Katedra Biochemii i Chemii Klinicznej istnieje w strukturach Wydziału Farmaceutycznego od 1991 roku, ale jej początki sięgają roku 1961. Po reorganizacji struktury Uczelni po roku 1968 z Katedry powstały dwa zakłady: Zakład Metabolizmu Leków oraz Zakład Analityki Klinicznej przekształcony następnie w Zakład Patobiochemii i Chemii Klinicznej.
W roku 1991 z inicjatywy Prof. Jana Pachecka dokonano połączenia obu Zakładów i utworzenia Katedry i Zakładu Biochemii i Chemii Klinicznej.
Pierwszym kierownikiem Katedry był prof. dr hab. Jan Pachecka, który pełnił tę funkcję w lalach 1991-2009. Prof. Jan Pachecka położył ogromne zasługi dla powołania w roku 2002 na Wydziale Farmaceutycznym Oddziału Analityki Medycznej przekształconego następnie w Oddział Medycyny Laboratoryjnej.
W roku 2009 kierownictwo Katedry objął prof. dr hab. Dariusz Sitkiewicz, który dokonał zmian w strukturze jednostki stymulujących rozwój działalności naukowej pracowników. W roku 2010 powstały cztery zakłady naukowo-badawcze: Zakład Biochemii, Zakład Biologii Molekularnej, Zakład Farmakogenomiki oraz Zakład Chemii Klinicznej i Diagnostyki Laboratoryjnej.
W związku z objęciem przez prof. Macieja Małeckiego, kierownika Zakładu Biologii Molekularnej, kierownictwa Katedry Farmacji Stosowanej, Zakład Biologii Molekularnej został przeniesiony do tejże jednostki. W tym okresie w Katedrze Biochemii i Chemii Klinicznej dokonano również modernizacji bazy dydaktycznej i unowocześnienia programów nauczania.
W roku 2011 obchodziliśmy jubileusz 50-lecia działalności naukowej i dydaktycznej Katedry. Konferencja Naukowa z tej okazji połączona z odsłonięciem tablicy pamiątkowej poświęconej Profesorowi Wiesławowi Tysarowskiemu – twórcy i pierwszemu kierownikowi Katedry, odbyła się 14 lutego 2011 r. Konferencja jubileuszowa była okazją do spotkania byłych pracowników Katedry a także przypomnienia jej wybitnych wychowanków. Wśród gości Konferencji było wiele wybitnych postaci polskiej biochemii wywodzących się z grona byłych pracowników Katedry a wśród nich Prof. dr hab. Joanna Rytka i Prof. dr hab. Grażyna Palamarczyk z Instytutu Biochemii i Biofizyki PAN oraz Prof. dr hab. Roman Lorenc z Centrum Zdrowia Dziecka.
W roku 2013, po przyjściu prof. dr hab. Dariusza Sitkiewicza na emeryturę kierownikiem Katedry została prof. dr hab. Grażyna Nowicka pełniąca jednocześnie funkcję kierownika Zakładu Farmakogenomiki oraz Prodziekana ds. Oddziału Medycyny Laboratoryjnej.
W związku z przejściem prof. Jacka Łukaszkiewicza na emeryturę Senat WUM zaakceptował dokonanie od 1 października 2016 zmian w strukturze Katedry Biochemii i Chemii Klinicznej i utworzenie dwóch zakładów: Zakładu Biochemii i Farmakogenomiki oraz Zakładu Chemii Klinicznej i Diagnostyki Laboratoryjnej.
W roku 2019 w struktury Katedry Biochemii i Chemii Klinicznej został włączony Zakład Medycyny Laboratoryjnej z siedzibą w Laboratorium Centralnego Szpitala Klinicznego Uniwersyteckiego Centrum Klinicznego WUM, którym kierowała dr hab. Olga Ciepiela. Z kolei w 2020 r. Zakład Chemii Klinicznej i Diagnostyki Laboratoryjnej, kierowany przez dr hab. Grażynę Sygitowicz, został zrestrukturyzowany i rozpoczął działalność jako Pracownia Diagnostyki Laboratoryjnej, która od 1.10.2022 została włączona w struktury Zakładu Medycyny Laboratoryjnej.
W roku 2023 działające w obrębie Katedry Biochemii i Chemii Klinicznej Zakłady Biochemii i Farmakogenomiki oraz Medycyny Laboratoryjnej zostały wyodrębnione jako niezależne jednostki Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego, a Katedra Biochemii i Chemii Klinicznej przyjęła nazwę Katedry i Zakładu Biochemii i Farmakogenomiki. Po przyjściu na emeryturę prof. dr hab. Grażyny Nowickiej i przeprowadzeniu konkursu z dniem 1 października 2023 r. funkcję kierownika Katedry objęła dr hab. Monika Czerwińska.
